清朝八旗制度的起源可以追溯到中国明朝末年，具体建立起来的过程是一个逐步发展的过程。

在明朝末年，辽东地区的女真族首领努尔哈赤建立了后金政权，并推行了锦衣卫制度，这可以视为八旗制度的前身。努尔哈赤将原有的男女一体的辽东女真兵源进行了调整，分设为正、副、佐三级旗官。同时，将原先的农民武装转变为专门的军事组织。

在建立后金政权的过程中，努尔哈赤的儿子皇太极继承了父亲的政权，并进一步完善了八旗制度。皇太极的主要改革包括废除旗官的世袭制度，并采取选任制度，这使得八旗制度更加合理和稳定。此外，他还在旗官之上创设了勋章制度，激励了八旗的官兵奋进。

在皇太极的改革下，八旗制度的组织架构逐渐完善。八旗分为正黄、正白、正红和正蓝四大旗，并分设为上、中、下三营，下设千户、百户等层级的军官。八旗制度不仅提供了统一的管理体系，还为清朝的军政管理提供了可靠的基础。

随着清朝政权的不断扩张，八旗制度逐渐向全国推广。顺治、康熙时期，清朝逐步征服了中原地区和中国南方的一些少数民族地区，这些地区的官兵也纳入了八旗制度。这使得八旗制度成为了清朝统一的军队组织和管理体系。

八旗制度的建立起源于明朝末年的锦衣卫制度，并经过努尔哈赤和皇太极的改革完善，最终成为清朝的主要军事制度。它为清朝的统一和昌盛作出了重要的贡献。